在根系類型、根系特征、根系各形態(tài)指標與根系構(gòu)型等方面的研究中,挖掘法、土鉆法、網(wǎng)袋法、圓筒法等是研究根系的常用傳統(tǒng)方法。為了能夠更快速、更準確地獲取植物根系信息,越來越多的科研人員開始使用植物根系掃描儀來分析根系。借助儀器掃描待測植物根,然后通過專用軟件進行分析,不僅能獲取根系長度、直徑、表面積、體積、根尖數(shù)、分叉數(shù)等形態(tài)指標,還能獲取拓撲參數(shù)。根系樣品量多時,還可打開多張根系圖像,自動進行批量分析;同時還支持手動校正分析結(jié)果,進行合并分叉、刪除連接、合并根尖、斷開連接、毛刺去除等操作。以下是托普云農(nóng)GXY-A植物根系掃描儀的詳細介紹:
技術(shù)參數(shù)
1、整體參數(shù):
(1)根尖數(shù):總根尖數(shù)量,等于終止連接點的數(shù)量
范圍:0-1,000
精度:誤差<5%
(2)根系長度:總的根系長度,包括主根和各級次根
范圍:0-10,000 mm
精度:誤差<3.65%
(3)平均直徑:根系的平均直徑
范圍:0-20 mm
精度:誤差 小于 0.04%
(4)投影面積:根系整體的投影面積
范圍:0-200,000 mm2
精度:誤差<4.02%
(5)表面積:整體的表面積
范圍:0-1,000,000 mm2
精度:誤差<3.75%
(6)體積:整體體積
范圍:0-2,000,000,000 mm3
精度:誤差<3.82%
2、拓撲分析參數(shù)(需要相對完整根系):
(1)數(shù)量:各級根的數(shù)量總和
范圍:0-1,00
(2)連接數(shù):各級側(cè)根上的連接數(shù)總和
范圍:0-100
(3)長度:各級側(cè)根的長度總和
范圍:0-10,000 mm
(4)直徑:各級側(cè)根的平均直徑
范圍:0-20 mm
(5)表面積:各級側(cè)根的表面積總和
范圍:0-1,000,000 mm2
(6)體積:各級側(cè)根的體積總和
范圍:0-2,000,000,000 mm3
(7)投影面積:各級側(cè)根的投影面積總和
范圍:0-200,000 mm2
功能特點
1.植物根系掃描儀(作物根系掃描儀)圖片預(yù)處理功能
1.1二值化:在目標和背景比較相似時,調(diào)整閾值來凸顯目標輪廓。
1.2雜質(zhì)剔除:設(shè)定一個像素值后,軟件自動剔除圖片中小于該像素的獨立點,以保證分析不受雜質(zhì)影響,更為準確。
1.3自由選擇目標區(qū):分析根系的某一部分。
2.輔助測量功能
2.1放大縮?。悍糯罂s小圖片以便對根系局部進行觀察和調(diào)整。
2.2自動標定:用戶輸入掃描像素后,軟件自動換算實際長度。
3.保存圖片、數(shù)據(jù)導(dǎo)出及追加
3.1保存圖片、數(shù)據(jù)導(dǎo)出:將圖片或數(shù)據(jù)導(dǎo)出至目標文件夾。
3.2數(shù)據(jù)追加:將該條數(shù)據(jù)追加至目標文件下方。
3.3直方圖導(dǎo)出:根據(jù)分檔參數(shù)不同,導(dǎo)出相應(yīng)的直方圖。
4.各個參數(shù)的自定義分檔
長度、直徑、投影面積、表面積、體積均可進行自定義分檔,分檔結(jié)果可導(dǎo)出。
5.大批量全自動分析:
打開多張圖片后,自動進行分析,并顯示分析進度,分析完成后自動導(dǎo)出至固定文件夾。
6.拓撲分析
選點后自動識別后用不同顏色標出主根及側(cè)根、自動計算側(cè)根數(shù)量。
7.還原至初始圖片:
在圖片進行分析或操作后,將圖片還原為剛打開時的狀態(tài)。
8.手工校正分析結(jié)果:
合并分叉、刪除連接、合并根尖、斷開連接、毛刺去除
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